上回讲到异时空的东蒙古草原各部开始遭受“后金”操控后，情况变得对“蒙古大汗”和“明朝”都不利了。
西元1623年5月，扎鲁特右翼色本惧怕治罪，先投靠科尔沁，后投靠后金。而努尔哈赤则加紧了招诱工作。于是，他先后争取了科尔沁奥巴台吉、林丹汗叔祖岱青台吉、内喀尔喀的恩格德尔台吉，又先后打败了扎鲁特左翼、巴林部等部落。可是，面对“后金”咄咄逼人的攻势，“大汗”林丹汗却无法组织有效防御。
等到皇太极继位后，更是采取了软硬兼施的办法，迅速征服了大批蒙古部落。首先，他拉拢并征服了内喀尔喀五部和科尔沁部，削弱了“蒙古大汗”林丹汗的力量。其次，他策动了奈曼部和敖汉部的投降，又以策动喀喇沁部投效的使臣被杀为由，出兵讨伐察哈尔，此战多尔衮和多铎立下大功，击败了多罗特部。
林丹汗被形势所逼，一怒之下则抢走了喀喇沁部苏布地塔布囊兄弟的部民和牲畜。而喀喇沁部领导拉斯喀布汗与土默特、鄂尔多斯、阿苏特、永谢布的部分台吉为了自保，遂联合起来与林丹汗的部队交战。
于是，后来在西元1628年7月，喀喇沁部首领决定归顺皇太极。到西元1628年9月，皇太极第二次率亲征“蒙古大汗”即林丹汗时，一起出兵的蒙古部落已有了敖汉部、奈曼、内喀尔喀、喀喇沁和科尔沁等部。
到了西元1630年11月，阿鲁科尔沁部长达赉楚琥尔、四子部落台吉伊尔扎布墨尔根台吉、阿鲁伊苏特部台吉齐桑达尔汉、噶尔玛伊勒登等各率所部先后归顺了“后金”政权，这极大的削弱了“蒙古大汗”的力量。
西元1632年3月，皇太极第三次亲征察哈尔的“蒙古大汗”本部时，参战的蒙古部落已经有了科尔沁、札鲁特、巴林、奈曼、敖汉、喀喇沁、土默特、阿鲁科尔沁、翁牛特、阿苏特等部，总兵力约为10万骑兵！
有蒙古人偷马告知林丹汗消息，林丹汗本欲逃往漠北喀尔喀三部，但后者却与其关系疏远。于是，他决定向西迁移，经呼和浩特渡黄河并到达了鄂尔多斯草原，使“后金”追之不及而还，归途收集数万部众。
“蒙古大汗”林丹汗在鄂尔多斯“成吉思汗”陵前宣告自己是“林丹巴图鲁汗”，然后率领察哈尔部和鄂尔多斯部前往甘肃大草滩。到达了大草滩后，喀尔喀却图台吉（土谢图汗部）率所部4万人与林丹汗部众会合。
他们通过“红教”与藏巴汗建立关系，但在西元1634年，林丹汗突然去世了，其遗孀大夫人苏泰和长子额哲率察哈尔和鄂尔多斯部返回鄂尔多斯草原，却图台吉则进入了青海，造成了对明朝边镇的冲击力度。
西元1636年3月，在得到漠南蒙古16部49人的拥戴后，皇太极正式称“博格达彻辰汗”，改国号为“清”，改元“崇德”。于是，漠南蒙古全部归顺“满清”，而清朝也将皇太极的次女嫁给额哲，并册封额哲为“亲王”，将察哈尔分为8个旗，设“都统”和“副都统”进行管辖。当然了，满洲贵族还分别娶了林丹汗的“八大福晋”。
所谓“娶了林丹汗的‘八大福晋’者”，其实就是把“蒙古大汗”的老婆们瓜分殆尽，毕竟在草原游牧民族严重，女人的生育能力与猪、马、牛、羊、骆驼等牲畜能为人类提供生存资料一样，也是一种“重要资产”。
于是，从西元1206年——西元1635年，“成吉思汗”所建立的“大蒙古国”寿终正寝。到了西元1641年，额哲去世后，其弟阿布奈继承袭爵，惟有阿布奈其子布尔尼作乱，被康熙帝处死，使“察哈尔亲王”被废。
纷纷扰扰四百年，“大蒙古国”的历史有过辉煌，有过衰败，有过非“黄金家族”的鬼力赤和也先称雄大漠，也有“黄金家族”的“达延汗”和“俺答汗”热衷恢复“元朝”，更有“满都海夫人”和“三娘子”这等蒙古女英雄！
但是，他们的业绩都已经烟消云散，只留下草原上的敖包静静矗立，告诉后人这片土地上的曾经发生过的盛衰兴亡，但在中国古代历史上，农耕民族和游牧民族的战争总是持续不断的进行着，就比如现在。
秦汉和匈奴、隋唐与突厥、两宋和辽金、明朝和满蒙，都曾经上演了长期的对峙和拉锯。到了明朝，北方大漠成为了蒙古人的天下，而明朝和蒙古在“边墙”（长城）上下对峙了200多年，这还不包括“后金”。
西元1368年，朱元璋的大军攻破了北京，标志着元朝作为当时的大一统王朝正式宣告灭亡。同年，朱元璋在南京称帝建立“明朝”。元朝灭亡后，蒙古势力基本退回大漠，但尚未放弃“元朝”国号，史称“北元”。
于是，朱元璋时期对蒙古的战争，主要就是用武力逼迫逃回大漠草原的蒙古人放弃“大元”这个国号。
西元1369年，朱元璋派遣常遇春、李文忠率领步兵8万、骑兵1万进攻“北元”上都开平。这次出征很顺利，因为城破之前，元顺帝孛儿只斤?妥欢帖木儿就被迫逃亡到应昌（今内蒙古赤峰）。据说，元顺帝当时还作下一首歌来表达自己的悲伤：“失我大都兮，冬无宁处；失我上都兮，夏无以逭暑”。亡国之君苦啊！
此后，朱元璋又陆续派遣大军北征北元。西元1370年，朱元璋派遣徐达、李文忠、邓愈、冯胜、汤和统领大军，分3路进攻蒙古。其中，李文忠为东路，从居庸关进入大漠；徐达为中路；冯胜为西路，主要从河西一带进攻蒙古人。这次出兵，徐达在沈儿峪口大败王保保，俘获北元官员1800多人，士兵8万多人。
此时，元顺帝因哀伤过度而突然去世了，其继承者和宗室又逃亡到了后世外蒙古国的古都哈拉和林。
从西元1368年元大都被明军攻克开始，明洪武三年(西元1370年)，元顺帝妥欢贴睦尔死于应昌，元朝太子爱猷识理达腊继位，即“元昭宗”。于是，北元朝廷退据哈拉和林，仍用“元”作为国号，故史称“北元”。
当然，后世史学家中也有人称“北元”为“残元”。“北元”政权仍以外蒙古哈拉和林之为首都，苟延残喘。
西元1387年，明军攻克了哈拉和林，并将此城彻底毁掉。之后，哈拉和林虽数次被重建，但因西元15世纪初期的蒙古诸部分崩离析，而鞑靼与瓦剌两部蒙古贵族之间相互攻伐，导致首都哈拉和林逐渐没落。
现今，外蒙古国哈拉和林市博物馆中还保存有《兴元阁碑》，刻于元惠宗至正二年（西元1342年），见证了蒙元帝国的兴衰，当然也见证了自己所在的“黄金家族”是如何一步步走向衰败的，毕竟天道有常。
西元1372年，朱元璋派遣徐达、李文忠、冯胜各率五万骑兵，三路出兵进攻北元。此次出征，徐达的中路军遭到了扩廓帖木儿和贺宗哲的围攻，大军死伤惨重，不得不退兵。而西路和东路却得到了胜利，但是收获却很少。因此，大军回朝后，朱元璋“赏罚俱不行”，毕竟这样会容易引起军心动摇，不如压下去。
同时，朱元璋也感觉到蒙古草原的势力难以短时间内彻底平定，于是便将对大漠草原的战略从进攻转而防守，并命令大军驻扎在长城以南，长期驻屯，修建城池，加强边防。这时，明朝开始重新修建长城。
但是，朱元璋为了避免秦、汉王朝修长城时强征民夫的恶劣影响，便把“长城”改名叫“边墙”，以避讳。
西元1382年，明朝军队已经消灭了云南梁王的势力，于是开始和“北元”争夺东北地区。西元1387年，冯胜、蓝玉、傅友德率领明军击败了元朝镇守辽阳行省的纳哈出，并将辽东地区强行纳入了明朝的版图。
为了进一步击败东北的“残元势力”，朱元璋于当年9月命令蓝玉、唐胜宗、郭英北伐蒙古，大军一直打到了“捕鱼儿海”（贝加尔湖），杀死北元官员1000多人。此后，北元皇帝在逃亡和林途中，被部将所杀。
从此，蒙古本部陷入了长期的分裂。而新的蒙古首领已经不再称“皇帝”，而改称“大汗”，而且“元朝”的国号也被蒙古人放弃了。这标志着以“黄金家族”为最高统治集团的“北元政权”已正式灭亡，历史重新开始。
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