自淳于炀离开京城前往黔州封地后，京城便变成了淳于靖的天下。他顺利迎娶叶迎柔为正妃，和安世侯府结了姻亲关系，更是得到了许家的财力支持。
他以为淳于炀没了兵权，又被发配南疆，京城中再也没有人能和自己争夺储君之位，可皇帝就是迟迟不肯立储，宁愿空置着储位两年之久。
就在淳于靖猜想皇帝是不是打算等淳于炀三年守孝期满，与叶翩然成婚后再立储的时候，他安插在宫中的眼线传来消息，说皇帝已经写好诏书，要立六皇子淳于善为太子。
淳于靖辛辛苦苦筹划了这么久，本以为储位已经是囊中之物，却没想到皇帝宁愿立一个废物为太子，也不宁愿把江山交到他手上，气得七窍生烟，便开始着手准备要夺位。
他知道淳于善和柳绿萝关系不错，又知道柳绿萝是叶翩然师傅，觉得柳绿萝能解叶迎柔的毒，为了防止篡位的计划失败，他开出高价想拉拢柳绿萝进入他的阵营，但却被柳绿萝拒绝了。
柳绿萝说他是仇人的儿子，就算是死也不可能帮他。
柳绿萝随后被人发现死于焚香院中，顺天府来查案，循着蛛丝马迹最后也只查到是江湖流寇动的手，但其实是淳于靖为了永绝后患杀了她。
柳绿萝的师兄，曾经的左相府大夫莫友光连夜快马加鞭感到黔州，将柳绿萝被淳于靖谋杀的事情告诉了叶翩然。
与此同时，淳于靖开始实施了他的篡位计划，皇帝再次中了叶迎柔所下的毒，病倒在了榻上。太医诊脉后说是普通风寒，但怎么治疗都没有任何好转，而且还日益加重，这让皇帝心中警铃大响。
他记起上一次自己病倒时也是这样的症状，随后庄贤妃过来照顾他之后没多久就死了，他本能的察觉到这两次之间定有什么关联，仔细回想后发现这两次病倒前夜都与敏贵妃有接触。
而敏贵妃是淳于靖的生母。
皇帝要立淳于善为太子是早就想好的事，并没有与别人说过，写诏书的时候身边也没有任何人，但他猜想他要立淳于善的消息一定被人传了出去。
帝王的危机感让他意识到自己的处境十分不妙，他叫来最信任的影卫，派他暗中前往黔州传淳于炀回京，又将立淳于善为太子的诏书藏了起来。
淳于靖的势力早已渗透到宫中每一个角落，他得知皇帝派人去黔州召回淳于炀，便派杀手一路除掉他们，若是除不掉，就尽量拖延他们的脚步。
叶翩然在得知柳绿萝死在淳于靖手上时，就猜到淳于靖想篡位，不等皇帝的召唤，她与淳于炀便已在回京的路上。
淳于靖派去杀淳于炀的杀手以姬临川为首，都是江湖上排名靠前的杀手组织。姬临川曾败在淳于炀手下，断了一只手，对淳于炀恨之入骨，这次的截杀任务正合他意。虽然淳于炀早已赶回京城，但姬临川的速度也很快，淳于炀和叶翩然才刚到蜀州就碰上了姬临川。
这些年得益于叶翩然所拥有的空间异宝，淳于炀的武艺比起两年前更为精进高强，姬临川早已不是他的对手，但他急着回京，姬临川意在杀人，两人在路上数次交手，谁也没有讨到好处，却也成功的拖延住了淳于炀的脚步。
当淳于炀忍无可忍将拦截的杀手杀得一干二净，和叶翩然一起赶回京城的时候，皇帝已经“病”死了，淳于善也失踪了，淳于靖凭着假诏书登基为帝，改年号康宁。
淳于炀突然出现在京城，当着满朝文武百官的面质问淳于靖皇帝的死因，淳于靖拿出数条证据证明是淳于善杀了皇帝，淳于善篡位不成害怕追责，已逃得不知所踪。
然后，淳于靖以淳于炀没有诏书便随意离开封地的举动，反诬告他是想效仿当年的岳亲王谋逆？然后当即让禁军将他扣押下来，关进了大牢。
禁军并不是淳于炀的对手，但淳于炀自然不可能动手，动了手就坐实了淳于靖所说他想谋逆。于是他只能按兵不动，静候时机。
得知淳于炀被淳于靖关了起来，叶翩然连夜求见淳于靖。
时隔多年再见叶翩然，尽管被叶迎柔下了心蛊，淳于靖还是克制不住对叶翩然动了心，想要得到她、征服她的念头疯狂蔓延，当即就想对她用强，逼迫她成为自己的人。然而他却没想到这举动惊动了叶迎柔种下的心蛊，当即被心蛊反噬得七窍流血。
发现心蛊居然有反噬的迹象，叶迎柔察觉不对，连忙便朝着淳于靖的寝殿赶去。当她赶到寝殿时，淳于靖已经恢复如常，并且她发现自己与淳于靖体内的心蛊失去了联系。
原来叶翩然与淳于靖交换了一个条件，只要她能帮他除去体内的心蛊，他便要放淳于炀离开京城。
淳于靖本来不愿同意，叶翩然又加了一个条件，那就是她留在京城为人质，淳于靖这才同意放淳于炀离开。
淳于炀不放心叶翩然留在京城，但叶翩然让他放心，先回黔州养精蓄锐。
其实淳于善并没有失踪，而是被淳于靖打断了双腿，关在黑水牢里日夜折磨。叶翩然留在京中为质时，一边暗中查找淳于善的下落，一边收集当年淳于炀分布在京城的人脉，让他们慢慢渗透进宫中。淳于炀回到岭南后，表面上做出一副受制于淳于靖的样子，但他私底下却在整肃自己曾经带领的玄甲军，准备等待合适的时机杀回京城救回自己的妻子，并斩杀淳于靖。
叶翩然终于在黑水牢中找到被折磨得不成人形的淳于善，她伪造出淳于善不堪折磨死掉的假象，将淳于善救出来，日日用灵泉温养他的身体。淳于善慢慢恢复了正常。
叶言勋自从回到公孙瑗身边后，也被叶翩然重新接好了手脚筋，虽然走路还有些跛脚，但已经能够自如行动。他这次也跟随叶翩然回到了京城，但他并未公开露面，而是悄悄回到叶迎柔身边，并重新取得了叶迎柔的信任。
靠着叶言勋，叶翩然安排的人完全渗入到宫中，搜集着淳于靖与叶迎柔谋逆的所有证据。
一切准备就绪，在又一个中秋月圆夜，淳于善拿着皇帝当年真正写下的诏书出现在宴会上，百官哗然。淳于靖让专门听命于他的金吾卫以谋害先帝的罪名捉拿淳于善。然而“金吾卫”忽然倒戈，并且拿出了所有淳于靖与叶迎柔合谋杀害前太子、太子妃，毒杀皇帝和七皇子，延误粮草导致前线失守、假传诏书，谋逆篡位等等证据。
与此同时，淳于炀带着玄甲军出现在京城，在金殿上斩杀淳于靖。而叶迎柔从城墙上跌落，被玄甲军的长枪扎成刺猬而死。
淳于靖死后，淳于炀拥淳于善登基为帝。随后，就带着玄甲军和叶翩然，前往边关抵御外敌。成功击退西凉、北邙、大越的盟军，定下百年不战的协议后，他返回京城，交还虎符和玄甲军，带着叶翩然从此云游四海，远离京城。