拿破仑赶到前线后，凭借他的军事天才和敏锐的观察能力立刻注意到奥军的一个致命弱点：把一支强大的军队置于敌人可以从后方打击的地方。他马上抓住机会加以利用。
拿破仑通过制造假象，在奥军后方空虚之处秘密但并非密不透风地建立了一支由新兵和过期服役的老兵组成的预备队，从而使奥军对自己的后方更为放心，以为拿破仑企图迷惑他们以解热亚那要塞之围。
但与此同时，拿破仑组织了一支真正的精锐部队，秘密而迅速地通过欧洲天险阿尔卑斯山隘道，出现在奥军的后方。1800年6月14日，法奥两军在马伦哥进行了大会战。结果在双方损失都很惨重的情况下，奥军最终败下阵来。
马伦哥战役之后，法奥和平谈判即开始。谈判一直持续到同年12月，当法军再次于战场上重创奥军并向维也纳乘胜进军时，奥地利才最终于1801年2月接受了拿破仑所提出的相当苛刻的《吕内维耳和约》。
同时，拿破仑又采取了一个重大的外交策略：利用英俄矛盾，说服俄皇保罗一世放弃了干涉法国内政的意图，并于8月29日宣布对英国所有船舶的封港令，把英国从波罗的海排挤出去。至此，第二次反法同盟实际上已经瓦解，只剩下孤单单的英国。英国不得不放弃战争手段，接受和谈。1801年10月，英法和谈开始，1802年3月两国签署《亚眠和约》。
拿破仑凭借其杰出的军事天才和政治才能，赢得了战场上的胜利，瓦解了第二次反法同盟，并使国内获得了和平。这一切使拿破仑赢得了极高的声誉。1802年8月2日，法国议会作出史无前例的“全民决定”，宣布拿破仑为法兰西共和国的终身执政。
《拿破仑法典》
1804年，法国公布了《法国民法典》，拿破仑在任法兰西共和国的第一执政时亲自参与编纂了这部法典。1807年和1852年，法国先后将这部法典命名为《拿破仑法典》，以纪念拿破仑对这部法典的卓越贡献。因此，《法国民法典》又称为《拿破仑法典》。
拿破仑曾经自豪地夸耀：“我的光荣不在于打胜了40场战役，滑铁卢会摧毁这么多的胜利……但不会被任何东西摧毁的，会永远存在的，则是我的民法典。”
《法国民法典》的草拟和制定工作，主要是1799年执政官制度确立以后开始的。
1800年，执政府任命四名法律专家组成的起草委员会负责民法典的起草工作。拿破仑亲自参与《民法典》的起草指导工作，他要求编纂者要“做治理国家的政治家，不要做法律的制造者”。
法典草案除了交枢密院审议外，还送交法国各法院征求意见，然后分成36个单行本由法国国会通过。在帝国建立后，它们被综合为《法国民法典》，于纪念法国革命纪元十二年的风月三十日，即1804年3月21日，最后以法律的形式通过。
《法国民法典》分总则：法律的公布，效力及其适用。第一篇：人法，包括民事权利的享有、人格的保护、住所、监护、教养、父母子女间的关系、婚姻配偶之间的关系、宣告婚姻无效或离婚而解除婚姻。第二篇：物法，即对各种财产权（所有权、用益权和役使权）的规定。第三篇：取得财产的各种方法，即继承、赠予，结婚时授予妻子的财产和债务关系，以及关于各种契约、法定的和约定的抵押、诉讼时效和权利取得的法定期限的规定。肯定了传统罗马法将债务关系分为契约、准契约，不法行为和准不法行为。这部民法典共35章，2281条，文字简明，逻辑严谨，体系完备。通观这部法典，它所贯彻的基本原则是：自由和平等，契约自由或契约自治，以及私有财产不可侵犯。
《拿破仑法典》的问世与颁布施行，在法国乃至欧洲的法律史上起了一个分水岭的作用。它标志着一个旧时代的结束和一个新纪元的开始。1789年资产阶级大革命之前的法律称为古代法，而在此之后的法律则称为现代法。
1804年3月21日，拿破仑签署法令，《法国民法典》正式在法国颁布实施。《法国民法典》的颁布，既是拿破仑夺取政权后的第一项重大改革，也是他巩固政权的一项具体措施。