菲律宾已探明的矿产中，黄金储量居世界第三位（已探明的黄金储量5800吨）、铜矿储量居世界第四位、镍矿储量居世界第五位、铬铁矿储量居世界第六位。
吕宋岛有丰富的金矿、铜矿、铬铁矿，还有铁矿、煤矿。岛上黄金资源最丰富的是碧瑶（Baguio）地区、比科尔（Bicol）半岛。碧瑶地区已探明的黄金储量在800吨以上，主要是砂金矿、岩金矿、铜金矿。碧瑶附近的每条山谷都有砂金矿，砂金矿最丰富的是碧瑶东部的阿格诺河（Agno河），其次是克莱河（Cy Creek）。碧瑶地区除了砂金矿外，还有很多岩金矿、铜金矿，中型以上的岩金矿、铜金矿有位于碧瑶的碧瑶金矿，有位于碧瑶东部的安塔毛库（Antanok）金矿、阿库潘（Acupan）金矿、桑库斯克毕谷金矿、巴拉托克（Batoc）金矿（该金矿闭矿后，成了旅游景区）；有位于碧瑶东北90公里的维多利亚（Victoria）金矿；碧瑶东北的曼卡延（Mankayan）矿区是铜金矿区，有艾托贡（Itogon）铜金矿、远东南（Far Southeast）铜金矿、勒班陀（Lepanto）铜金矿、帕蒂卡尔（Padical）铜金矿、特雷萨（Teresa）金矿（黄金储量386吨）、加姆邦（Gab）铜金矿、法蒂马（Fatima）铜金矿、马托里纳克（Matulinac）铜金矿、卡门（Carmen）铜金矿、东佛罗伦萨（Florence East）铜金矿、西佛罗伦萨（Florence West）铜金矿、布奥基（Buaki）铜金矿、塔维塔维（Tawi Tawi）铜矿等；在碧瑶北偏东28公里有博能（Boneng）铜矿（1974年开采），碧瑶西南31公里有圣托马斯（Santo Tomas）铜金矿，碧瑶南偏东17公里有菲莱克斯（Philex）铜金矿。在这么多金矿、铜金矿中，碧瑶金矿黄金储量132吨，安塔毛库金矿和阿库潘金矿的黄金储量超过800吨，维多利亚金矿的黄金储量超过133吨，艾托贡金矿的黄金储量超过105吨，远东南铜金矿的铜储量达226万吨、黄金储量达453吨，勒班陀铜金矿的铜储量为73万吨、黄金储量116吨、银储量363吨，帕蒂卡尔铜金矿的铜储量14.3万吨、黄金储量40吨，圣托马斯铜金矿的黄金储量170吨，菲莱克斯铜金矿的矿石量在1.5亿吨以上。
另外，吕宋岛北部的康纳（Conner）镇附近有康纳铜金矿，在卡加延河谷中部伊拉甘（Igan）东北32公里的蒂维拉坎（Divican）地区有塔布克（Tabuk）铜矿。吕宋岛西南部奥隆阿波城（Olongapo）北偏东15公里有迪宗（Dizon）大型铜金矿，矿石量在2亿吨以上，铜品位0.4%，黄金品位0.93克/吨，银品位2.5克/吨，还有较高品位的汞可回收。卡加延河谷盆地南部的迪迪皮奥（Didipio）有迪迪皮奥铜金矿、丁基迪（Dinkidi）大型铜金矿，其中皮皮迪奥铜金矿的矿石量为2000万吨，2013年开采，铜储量16万吨、铜品位0.65%，黄金储量36.9吨、黄金品位1.7克/吨；丁基迪铜金矿位于迪迪皮奥南偏西10公里，于1997年勘察发现，已探明的铜储量达50万吨、铜品位0.4%，黄金储量124.4吨、黄金品位1.0克/吨，在迪迪皮奥南还有新维斯卡亚（nuevo Viscaya）金矿，在迪迪皮奥北38公里（属伊富高省）有马利安（Marian）铜金矿。在马尼拉东北38公里有蓝贝（Lumbay）铜金矿（1977年发现），在八打雁有泰桑（Taysan）铜金矿。
在吕宋岛东南部的比科尔半岛，东部沿海从何塞·庞阿尼班（Jose Panganiban）到帕拉卡莱（Paracale），再到宾松斯（Vinzons），有大大小小几千个砂金矿、岩金矿、铜金矿，被统称为“帕拉卡莱金矿区”。该地区的金矿早在19世纪末就发现，何塞·庞阿尼班因有太多的黄金，被当地人称为曼布拉奥（Mambuo），意思就是“富产黄金”，矿砂中富含铬铅矿、磷铬铜铅矿，比如在庞阿尼班西部半岛的东海岸有著名的巴拉贡（Gallego，也称加拉贡）金矿，19世纪末就开采，闭矿后留下了一个巨大的矿坑。在帕拉卡莱地区由正规采金公司开采的砂金矿有班敦·纳库拉奥（Bantun Nakuo）砂金矿、哈利格因·巴托（Haligoing Bato）砂金矿、卡劳（Kaw）砂金矿、隆格斯（Longos）砂金矿、帕拉卡莱砂金矿、圣罗萨（Santa Rosa）砂金矿、联合帕拉卡莱（United Paracale）砂金矿等。该地区好多砂金矿位于沼泽地，如在帕拉卡莱、拉博（Labo）地区，由于采矿技术落后，正规公司都不愿意开采，当地人就冒着生命危险，潜水进入地下十几米的水中淘金，于是就有了几千家私人采金点，很多家庭就靠淘金谋生。
吕宋岛西南部的三描礼士山脉（Zambales Mountains）有丰富的铬铁矿，已开采的铬铁矿有62个，其中位于圣克鲁斯（Santa Cruz）南东约16公里的阿科杰（Acoje）铬铁矿，储量348万吨，是菲律宾最大的冶金级铬铁矿；位于马辛洛克（Masinloc）地区的科托（Coto）铬铁矿，储量530万吨，是菲律宾最大的耐火级铬铁矿。
吕宋岛的铁矿主要集中在三描礼士山、比科尔半岛北部的庞阿尼班（Panganniban）、邦多克半岛（Bondoc Peninsu）的穆拉奈（Munay）地区。吕宋岛铁矿的缺点含硫量、含硅量比较高，硫品位大多在4%左右，二氧化硅含量在20%左右，选矿、炼铁时成本会增加，不过吕宋岛铁矿也有优点，那就是矿石中大多含铜、金、银。比科尔半岛已探明的铁矿储量在1.5亿吨左右，这些铁矿的上半部为铁矿，下半部却是铜金矿。如庞阿尼班西部半岛有个拉拉普（Larap）铁矿（与巴拉贡金矿相邻），1833年就开采铁矿，到1975年闭矿时共开采了1.4亿吨铁矿石，后来发现铁矿体的下盘竟然有厚大的铜、钼矿体，伴生金、银，2010年中国某公司接手时，铁矿石保有储量782万吨，尽管铁品位只有23.8%，但伴生的铜储量11.26万吨、品位0.48%，钼储量1.4万吨、品位0.07%，钴储量4600吨、品位0.015%，黄金储量9.8吨、品位0.3克/吨，银储量42.23吨、品位1.8克/吨，另外矿区还有20多吨的砂金矿，该公司买下这个铁矿后，仅开产砂金矿，就能赚大钱，从中也看出菲律宾人的探矿能力有多差！庞阿尼班西南2.5公里有个杜马口（Domaco）铁矿，1935年发现，1939年开采，矿石量约1000万吨，铁品位40%左右、铜品位0.32%，该铁矿的东北沿海就是巴拉贡金矿。拉拉普铁矿附近还有阿古桑铁矿（矿石量3140万吨）、033铜矿、085岩金矿（储量3.56吨）、085砂金矿（黄金储量50吨）、318铜钼矿（矿石量9000万吨，铜品位0.24%，钼品位0.024%）、066铅锌矿（铅锌储量31.3万吨、铜储量6.7万吨、黄金储量2.97吨）、贝塞默铜钼矿（铜储量7.1万吨、钼储量1.5万吨）。穆拉奈的铁矿也是个大型铁矿，1956年发现，分东、西两个矿段，矿石量在1亿吨左右。在吕宋岛西北部帕苏金（Pasuquin）沿海的沙滩里还有数千万吨的磁铁矿砂，埋于水面下7米，开挖这种铁矿砂时，可以直接用磁选，可省去采矿、破碎、球磨等工序。
吕宋岛马尼拉东南部的安蒂波洛（Antipolo）有汞矿，该矿于1955年开采，1976年因环保原因闭矿。
吕宋岛上的非金属矿产也极为丰富，主要是石灰石、白云石，仅马尼拉周边就有很多石灰石矿，如马尼拉东北的罗德里格斯（Rodriguez）、圣何塞·德尔蒙特（San Jose del Monte）就有很多采石场，开采石灰石、花岗石、大理石、白云石。吕宋岛也有磷矿、煤矿，如南部的八打雁地区就有磷矿，煤矿主要分布在东部的马德雷山（有8个煤矿）、林加延湾东部的罗萨里奥（Rosario）地区（有2个煤矿）、东南部的比科尔半岛（有2个煤矿），在吕宋岛南部的卢塞纳（Lucena）、阿格丹甘（Agdangan）各有1个煤矿。不过，吕宋岛上的煤矿都是中小型煤矿。
波利略岛，位于吕宋岛东，面积约615平方公里，岛上有小型金矿、铅锌矿、煤矿。
卡坦端内斯岛，位于吕宋岛比科尔半岛东，面积约1460平方公里，岛上有小型金矿、银矿、锰矿、磷矿、煤矿、大理石矿。
卡格拉赖岛，位于吕宋岛比科尔半岛阿尔拜湾北部，面积约80平方公里，岛上有4个小型煤矿。
位于吕宋岛比科尔半岛阿尔拜湾东部的拉普拉普岛，面积约70平方公里，岛的南部有希克斯巴（Hixbar）露天铜金矿，铜储量8.76万吨，锌储量14万吨，黄金储量18吨，银储量220吨。
民都洛岛（麻逸岛），被西班牙人于16世纪占领后不久就发现了金矿，因此被西班牙改名为“Mindoro”（民都洛）岛，取名来自于西班牙文的“Mina de Oro”，即“金矿”之意。民都洛岛有金矿、铜矿、镍矿、煤矿。砂金矿主要位于东北部的卡拉潘（Capan）地区，岩金矿主要位于哈尔孔山（Halcon）；铜矿主要位于岛的西部地区，如Amnay地区就有铜锌矿；镍矿位于中部的卡拉姆潘（Campuan）地区，已探明的矿石量达2.25亿吨，镍品位0.94%、钴品位0.07%；煤矿主要位于岛的南部，如芒阿林湾（Mangarin湾）沿岸就有很多煤矿。
塞米拉拉岛，位于民都洛岛南，尽管岛的陆地面积只有57平方公里，但岛上有大型煤矿，煤炭储量3.7亿吨，是菲律宾煤炭的主要产地。
马林杜克岛，位于民都洛岛东，南北长38公里，东西宽35公里，面积759平方公里，岛上不仅有铜金矿，还有铁矿，今岛的中部就有Tapin、Sanantonio、Capayang三个铜金矿，其中后2个是露天矿。Capayang闭矿后，被辟为矿山公园。
班乃岛，面积达1.2万平方公里，有铜矿、铬铁矿、煤矿、磷矿、硫磺矿。
马斯巴特岛，位于班乃岛东北部，面积约3300平方公里，早在元代就有中国人在岛上的阿罗罗伊（Aroroy）地区采集砂金。阿罗罗伊南部就有二大金矿，一个是海边的辛迪加（Syndicate）露天金银矿，曾为菲律宾第二大金矿，矿石量9400万吨，黄金储量244吨、黄金品位2.6可/吨，银储量338吨、银品位3.6克/吨，另一个是马斯巴特露天金矿，矿区面积达83.3平方公里，最高峰时年产4吨黄金。岛的东南部卡塔英岸（Cataingan）地区还有多个小型铜矿。
内格罗斯岛，面积1.27万平方公里，有铁矿、铜矿、金矿、煤矿、磷矿、石膏矿、硫磺矿。铁矿主要位于塔哥波（Tagpo）、罗诺伊（Lonoy）、拜斯（Bais）等地区，属于小型铁矿。铜矿主要位于锡帕莱（Sipay）、阿西亚（Asia）、巴塞（Basay）、巴亚万（Bayawan）、圣琼斯（San Jose）等地区，如锡帕莱西北有寇雷特（Colet）露天铜金矿，1936年开采，矿石量达6亿吨，铜储量249万吨、钼储量3.6万吨、黄金储量30吨，本世纪初闭矿后留下了一个巨大的矿坑；阿西亚有希诺巴安（Hinobaan）铜矿（位于希诺巴安镇东偏南10公里，铜储量180万吨）；巴塞地区有巴塞铜矿（位于巴塞镇北偏东10公里。该矿闭矿后，成了旅游景区）、萨吉邦（Saguibon）铜矿（位于巴塞铜矿北部）、阿亚阿亚（Aya-Aya）铜矿（位于巴塞铜矿南部）、马里卡尔姆（Maricalum）铜矿（1995年发现，铜储量200万吨）。金矿主要位于阿永翁（Ayungon）地区、锡亚顿（Siaton）及阿姆兰（Amn）河谷，大多属于小型金矿；煤矿、硫磺矿、石膏矿主要位于锡帕莱地区，磷矿主要位于锡帕莱及东海岸的吉胡尔岸（Guihulngan）地区，其中吉胡尔岸地区的磷矿属于大型磷矿，五氧化二磷储量10万吨以上，品位25%以上，地下开采。
吉马拉斯岛，位于班乃岛和内格罗斯岛之间，面积在600平方公里左右，岛上的山脉属于石灰岩质，因此岛上有丰富的石灰石，今北部的布埃纳维斯塔（Buenavista）地区就有数亿吨的石灰石矿。