成功修炼仙人模式后，小毅一直再开发更多的能力。但一件很重要的事让小毅不得不停下来。
阿墨：“那件事要开始了，我们得去看看。”
小毅也变得凝重起来。
自然也一脸雾水：“到底发生什么事了？什么要开始了？”
小毅歪着头看着自来也：“自然是木叶毁灭计划咯。”
“木叶毁灭？你想做什么？”自来也警惕起来。自来也一听到木叶毁灭计划，就想到了当初的大蛇丸袭击木叶，他的老师三代火影就是在那次袭击中死去的。而且小毅的力量他是知道的，木叶没有一个人能够挡住他，就算是修炼了仙人模式的鸣人都不可能。
小毅：“您放心，实施毁灭计划的不是我们，而是晓组织。”
“佩恩？”自来也提高了声音。
小毅点了点头。
“目标是鸣人吗？毅，立刻放我回去，现在木叶根本没有抵御佩恩的力量。”
小毅：“自来也大人，您现在都成这个样子了，难道还打得过佩恩吗？放心吧，这件事情会有办法解决的。”
小毅吩咐道：“赖人，将要塞开向木叶，我们去观战。”
“好。”
赖人听到又有战斗可以看，非常的兴奋。他控制着要塞快速前进，一个小时之后就来到了木叶的上空。
“好了，我们下去吧。”
自来也：“等等，我也要去。”
小毅看着自来也：“自来也大人，您可以保证不干涉这件事吗？”
“不可能，木叶不是佩恩的对手，我必须去帮忙。”
小毅：“我是不会让您出现在木叶的。即便是您去了也是没办法阻止佩恩的。我可以带您去，但您要保证不许接触木叶。另外，你不用担心，我可以向您保证这次的结果是好的。”
自来也想了一下，还是同意了。若是他不同意的话，可能连看都看不到了。至于到时候是否能行动，再做打算吧。
“好，我同意。”
“既然您同意了，那就请穿上这个吧，现在您是不能够露面的。”
小毅拿了一套袍子和一个面具。当然，小毅给自来也的并不是暮组织的面具。小毅是不可能让自来也加入暮组织的。自来也加进来了，所有的情报都会被泄露出去。而且说不定整个组织都会变得那样。
大家换上暮组织的衣服，然后就用飞雷神来到了木叶的火影岩上。
此时，佩恩六道已经开始攻击木叶，整个木叶瞬间变得混乱起来。
“混蛋！”自来也想要冲过去，却被小毅紧紧的拉住了。
“自来也大人，记得你打赢我的话。若你再想要乱动的话，我就只能送你回要塞了。”
“我明白了。”自来也站了回来。他也知道自己现在一身力量全部被封印，根本没有什么战斗力，只能就这样看着。
佩恩六道从不同的方向袭击木叶，大量的建筑被破坏掉。木叶的忍者们完全不是佩恩六道的对手，许多的忍者都被杀死了。不过好在佩恩的目标不是平民，平民们开始向避难所迁移。
自来也看着正在遭受破坏的木叶，非常的愤怒。“混蛋！长门，他到底想要做什么？”
赖人回答道：“应该是要捕捉九尾吧。可惜现在鸣人现在在妙木山，他们多半是找不到了。”
小毅忽然想到了一个有趣的问题。“自来也大人，您说是让鸣人回来，还是让他不回来呢？”
自来也看了一眼小毅，摇摇头：“鸣人知道的话，以他的性格绝对会立刻跑回来吧。这一次佩恩的目的就是为了抓住鸣人，若是鸣人回来，他们绝对会集中力量专门对付鸣人的，到时候鸣人很难战胜他们。”
自来也紧紧的握紧右手，若是自己能够战斗的话，情况也许会好一些吧。
小毅嘴角一扬：“那我就叫他回来。”
“不行！”自来也立刻拒绝，“现在鸣人回来就是送死！”
小毅忽然想起了一个更有趣的问题。“自来也大人，您说现在木叶的大家族们都知道有人来袭击了吗？”
自来也：“当然，这么大的动静，谁会不知道啊？”
小毅继续问道：“那为什么木叶各大家族的人以及所谓的根，都没有丝毫要出手的意思呢？”
自来也深深的看了一眼小毅，随即叹了一口气。自来也很明白，对于村子里的那些大家族来说，只要没有伤害到他们的利益，他们是不会出手的。这也导致了佩恩六道在木叶中肆意破坏，没有人能够阻止。
自来也看着木叶的惨状，实在是忍不下去了。“毅，你明明有能力，为什么不出手？”
“自来也大人，现在我并不是木叶的漩涡毅，而是暮组织的灯。今天包括您在内的所有人都不能出手，我们能做的就是看着这场战斗。”
自来也很想一拳打碎小毅，但他现在什么都做不了。
小毅貌似自言自语的说道：“参与抵抗晓组织的竟然只有新生代的几个忍者和一些守卫忍者，暗部也只有寥寥几个，实在是有些可笑呢。
说实话，若是木叶的全员出动，对抗六道佩恩那么也不是不行。但现在小毅所看到的就是只有那些新生代和那些不重要的忍者在拼命的战斗。老一辈的忍者们全部都龟缩在自己的领地之中。
自来也听到小毅的话，也深深的体会到了木叶家族的自私。他也明白，现在的木叶腐朽到了何等的程度。
就在这时，木叶的大楼上出现了一只巨大的蛞蝓。
“是纲手吗？”自来也看着蛞蝓的出现，便知道是纲手要出手了。
巨大的蛞蝓迅速分解成数百个小的蛞蝓。这些蛞蝓们去去寻找收拾的忍者，为他们进行治疗。
“自来也大人，您看这边。”
自来也向着小毅指的方向看去，发现是卡卡西正在和一个佩恩进行对战。
小毅：“那是天道佩恩，是佩恩六道的首领，也是最强的一个。”
自来也看着天道佩恩，对于那家伙的情报，他也了解的并不多。
“自来也大人，您说卡卡西能打过佩恩吗？”
很久之后，自来也才叹了一口气。“卡卡西确实很厉害，但他打不过佩恩。不过要拖住佩恩还是没问题的。”
但没过几分钟后，卡卡西就倒下来，生命气息也消失了。
自来也瞬间愣住了，他没有想到天道佩恩会那样强。他原本以为天道佩恩的力量和其他几个佩恩差不多，卡卡西应该能拖住，但没想到卡卡西这么快就输了。自来也想起了之前他和佩恩的战斗，若是一开始就遇到了天道佩恩，他也不会比卡卡西好多少。
卡卡西死后，六道佩恩继续在木叶破坏。越来越多的建筑变成了残骸，越来越多的人倒在地上。随着时间的过去，佩恩找遍了整个木叶都没有找到鸣人的所在。
“自来也大人，您看那边。”
自来也听到小毅的话心中一紧。他知道每当小毅指一个地方的时候，那边绝对会发生很严重的事情。
自来也向小毅指的方向看去，只见天道佩恩缓缓的升到了天空。
自来也发现其他的佩恩都消失不见了。“他到底想干嘛？”
小毅：“赖人，搀住自来也大人，别让他摔倒了。”
赖人走到自来也旁边，扶住了自来也的身体。
自来也恐慌的看着小毅，他意识到可能有什么极其严重的事情要发生了。
佩恩：“从现在开始，让世界感受痛苦！”
“超?神罗天征！”
天道佩恩使出了最强力量的神罗天征。以佩恩为中心，最大的斥力向四周弹出，木叶的街道在这种斥力中迅速的毁灭。整个木叶全部变成了灰烬。
当斥力消失后，除了火影岩以外，整个木叶全部都消失了。
自来也不敢相信的看着眼前的景象，身体一晃坐倒在地上。
即便是他和佩恩六道进行过战斗，他都没有想到对方竟然有如此强大的力量。拥有这种力量的佩恩，有谁能够击败他呢？
从未有过的绝望从自来也心中升起。
“自来也大人，您看那边。”
自来也听到小毅的话，自来也心脏一紧，难不成还有必这更恐怖的事情吗？
小毅所指的位置正是被神罗天征磨平的位置。原本空无一物的地方，不知道什么时候那边竟然多出来了一个人。
“鸣人！”自来也不敢相信的看着那个人，那正是他的弟子漩涡鸣人。
“毅，快带鸣人离开，他不是佩恩的对手。”
小毅：“自来也大人，你相信鸣人吗？”
听到小毅的话后，自来也一怔。是啊，鸣人可是自己最优秀的弟子，为什么不能相信他呢？
突然出现的鸣人和蛤蟆们看到眼前的景象，也非常的疑惑。他们来到的地方明明应该是木叶，但完全看不到木叶的景象。
将他们通灵出来的志麻走出来：“鸣人，这里正是木叶，木好好的看看周围。”
这时，鸣人和蛤蟆们才注意到，木叶已经完全被毁灭了。
鸣人忽然感觉到了什么，向着火影岩这边看过来。
小毅立即设下了一道屏蔽结界。他差点忘了鸣人在学会仙人模式后有感知查克拉的能力。
“感觉错了吗？”鸣人刚刚感觉到的熟悉查克拉忽然消失了。