宋启愚又说：“邓主事，你带着礼司的人现在到九莲寺去，找庆志方丈。九莲寺较为空旷，周围少有人家，本官打算把所有得疫病的人都安排在那里治疗。老方丈有慈悲心，又通医道，我想他愿意帮助我们做此善事。”邓主事说了个请大人放心，也去办差了。宋启愚又叫过水司主事杨澄，说道：“你带着水司的官员和工匠到药山去。在山脚有溪流处赶工建设五十间临时房，用以收容逃难的百姓，被服和用品先按三百套配备。后面，我们再根据实际，看是否要增加。”杨主事答应一声，退出了厅堂。宋启愚又说道：“徐主事，你们户司除了做好物资供应、生活保障和支出调度外，等疫情过去，如果有灾民不愿回乡，你们还要及时地给这些人登记户籍，划拨荒地，让他们有所营生。”徐主事拱手说：“属下明白。”宋启愚又指着兵司主事胡时壮说：“胡主事，你立即去泺口村。带上几名郎中，先给患病者诊治，然后再将他们迁往九莲寺治疗。另外，再带些衙役，把病死者的尸身和衣物焚化。咱这地方的人很讲究‘死者为大’、‘入土为安’，但现在是非常时期，对于阻挠焚化尸体的人，若劝止不住，可以当场锁拿。”胡时壮也唱了个诺，领命去了。宋启愚又转向刑司主事张硕，说道：“黄河渡口开化时间不长，估计从北方来我济南的人并不多，但是不能掉以轻心。你把刑司的人都派出去，收容城内外的乞丐和流民，给他们饭吃。这些人体质差，易得病，我们得降低这个风险。过后，把没收长清县令的土地分出一些租给这些人，也让他们有条活路。”胡时壮行了个礼说：“遵命，属下这就去安排。”
由于防疫及时，措施得当，这场在河北大地上肆虐了数月的瘟疫，在济南却吃了瘪，很快便被控制住了。
三月中旬，宋启愚亲自前往九莲寺，看望在那里治疗的最后一批疫病患者。安抚了这些人之后，宋启愚走进大雄宝殿，面对佛像，双手合什，嘴里喃喃地念道：“如是我闻。一时佛在舍卫国。祗树给孤独园。与大比丘众。千二百五十人俱……若菩萨不住相布施。其福德不可思量……如来者。无所从来。亦无所去。故名如来……”站在一旁的庆志方丈大为惊讶。待宋启愚施礼完毕，他合掌说道：“阿弥陀佛。大人竟能默诵整段《金刚经》，在众多官宦当中，能象大人这样精通佛法的，实在少见。”宋启愚躬身说：“方丈谬奖。我起初研习佛经只是为了静心，后来才发现佛祖‘普度众生，施惠宇宙’的教义与读书人‘穷则独善其身，达则兼济天下’的理想有诸多相似之处。我这才花了些心思，背诵了几段经文，实在难入方丈双耳。”庆志方丈又双手合什，施了一礼说：“大人太过谦逊了。我佛虽能度人，但多在救人之心；而大人出手助人，却能救人之身；我佛避世，而大人出仕，此二者正为互补。”
恰在此时，一道强烈的阳光透过门窗射在了大殿正中的佛像上。随着光线角度的变化，原本眼帘低垂的佛像好似突然慢慢睁开了双眼。庆志方丈欣喜地双膝跪地，高喊道：“佛祖睁眼了！佛祖显灵了！佛祖要注视我们这个世界了！阿弥陀佛，阿弥陀佛。这个世道终于有救了！”