方腊自从帮源洞率领教众和穷苦百姓起义以来，方腊对宋庭和宋军做了三个推测。第一个推测，让他推测对了，就是近年来由于花石纲在江浙一带的侵扰，特别不能令百姓忍受。只要能主持正义发动起义，江浙一带各地必定闻风响应，十来天的时间，就可聚众万人，这是起义成功的第一步。
方腊的第二个推测是，只要起义一爆发，地方官吏听到这一情况，一定会进行招抚，和我们商谈，不便于马上向朝廷申报上奏怕朝廷治罪。我们用计策牵制他们，拖上一两个月，江南江浙各郡可以一举攻下来。他的这二个推测也基本上都实现了。
方腊的第三个推测，却没有实现，而且变成了他的一个致命的失误。
这第三个推测就是，方腊认为，即是后来地方官吏敢报，宋朝廷在接到申奏后，也不能即刻决策发兵，预计拖拖拉拉，汇集商议，也需要一个多月，再加上要调集训练军队和调拔粮饷，没有半年决不可以。如此这样，我们起兵前后就已经一年了。在这一年的时间内，这时局势已经基本稳定，那时就更不需要担心了。
况且朝廷对西边北边的外敌的钱币进贡及军队费用每年都得用去不少，再加上朝廷军政费用每年多达几百万，这些钱财大多出自东南地区。我们已经占有了江浙江南东南地区，朝廷再得不到东南地区的半点钱粮，必将会残酷地向中原各地收取榨取。中原百姓忍受不了，必定也会起来反抗。西边北边的外敌知道了，也会乘机进攻。朝廷受到内外夹击，即是有伊尹和吕尚这样的谋臣，也不能为他们想出什么办法来。我们只要以长江为界，守住江南，减轻劳役，减免赋税，使百姓人力物力得到恢复和发展，十年之内，终将推翻宋庭统一天下了。
方腊的第三个推测，听起来颇有道理，但从现实出发，从一开始就是个错误。那就是，宋庭准备北伐夹击契丹辽国的十五万禁军，根本就不需要时间再做准备，只要朝廷一下令就可以出发，粮草方面准备北伐夹击契丹辽国已经准备充足，也再根本不需要时间去准备。于是方腊的第三个推测，从一开始就错，而且就会一错再错，一直错到底。令他完全没有想到的是，宋庭一接到快报，出兵又是这样的神速，而且所出的军队，又都是宋庭战斗力最强的东京朝廷的禁军，而且领兵前来身为太监出身的童贯，又是个善于玩弄权术会抓住人心的人。要不一个太监又怎么能混到这个份上，成了一个领兵的大（元）帅。
而且童贯在出兵前就先做好了动员，他的动员是什么样的动员？他在了解报信的信使所说的为什么数月来，贼乱都到了如此猖獗壮大的时候才来报信的原因后，就立刻对将要出兵的十五万禁军做紧急宣传动员，让信使亲自控诉方腊叛军失去头脑理智的行为举动。那就是方腊与方腊起义军，只看到与宋庭欺压百姓的暴官的仇恨，而没有感觉到这种仇恨盲目举动下所带来的副面作用。起义军凡是抓到宋军，不论军官和士兵，不论是投降还是俘虏的，都要处死而平民恨。这在童贯看来，正好可以以此而杜绝宋军官兵上下贪生怕死不战恐慌的弱点。于是，他让作报告的信使大言哭诉方腊叛军，凡是抓到俘获宋军不论是将军还是士兵，都要开肠破肚，挖心挖肺挖肝脏，定要割其肉，断其体，取其肺肠心肝，或者熬成膏油，再者乱箭穿身，用各种各样的办法折磨至死，以此而解对大宋国官军将帅与兵卒的心头之恨。
宋军禁卫军将士听了如此控诉，自然是都咬紧牙关，心里纷纷决心，即是战死了，也不能被抓住，更不能投降当俘虏。如此，这就更是大大的提高了宋军的战斗力，和上阵拼命不被俘不投降的决心。常言道一夫拼命十夫难当，童贯此时率领的十五万禁军，此时又得顶多少万军队的战斗力，这也是方腊起义军把宋军推到死敌位置上的一个重大致命的错误。
而且童贯所玩弄的花招又不是这一样，他的最拿手的花招还在后面。并且童贯这个人，尽管是一个太监，可是从表面和声音上，你又完全看不出这是一个太监。童贯不但长着男人仓劲有力乌黑的胡须，而且说话声音比男人还苍劲，完全不是一个太监应有的声音。也许上天当时开了个玩笑，把这样一个该是（元）帅之才的人给删错了，却又让他率领千军万马，还真为大宋打了不少胜仗，立下不少军功，否则一个太监又怎么能爬到如此位置上来呢。
童贯经历战阵已久，知道兵贵神速的作用。于是，从东京汴梁出兵率领十五万禁军没有多少日子，就率军很快到了江浙，宋军的忽然到来，这在方腊看来简直就如神兵天降，完全在他的预料之外。
方腊的失误不仅在于此，而且他的军队尽管发展到近百万人，可是他疏忽了军队的训练，没有及时操练提高军队的战斗力，和没有看到训练弓箭军队的作用，更是在将帅的运用方面没有提高他们的作战指挥能力，再加上将帅的缺乏，尽管将有百万之军，可是战斗力难以与前来的十五万宋军禁军匹敌。
而且，居然在情报军情的掌握上又是如此的蔽塞，童贯率领十五万禁军到了江浙，他却没有提前任何预知，自然要被宋军先发制人打个措手不及。而在这种情况下，方腊又把起义军过于分散，没有集中优势绝对压倒敌人的起义军力量，先对远道而来的宋庭十五万禁军以致命的痛击，和绝对性的歼灭，而为后来的惨败埋下了祸患，以致后来让宋军把过于分散的起义军各个击破。而同样都是童贯率领的十五万禁军，而后面契丹辽国又是怎么对待的，契丹辽国的大将萧干又是怎样的以少胜多获得大胜，令宋军不敢出战望风而逃，这不能不是一个鲜明的指挥才能的对比，和作战指挥的艺术上的不同。
当下，童贯率领这十五万宋庭禁军，第一个目标就是先赶扑秀州，以解秀洲之危。童贯率领禁军的先锋王禀是个有万夫不当之勇勇敢善战的勇将，他率领三万宋军禁军赶到秀州的时候，方腊起义军大将方七佛正在率领六万起义军攻打秀州，却还浑然不知十五万宋军禁军即将赶来增援解围，而在秀洲城外一战，被王禀率领的三万禁军，与秀州城里的宋军里外夹击，被王禀打得大败，仓皇溃退。这不能不说一个将领的失误，和作战能力常识不高的体现。
于是，童贯闻秀州一战大获全胜，便立刻下令乘胜追击，便一方面为了瓦解起义军斗志和军心，抓住要害之处，四处派人张贴以皇上宋徽宗的名誉取消花石纲，童贯还亲自以告示的形式，向百姓赔礼道歉，同时即可上述宋徽宗先罢免朱勔的官职，以取得百姓的信任。宋徽宗为了瓦解起义军的军心，果然从其言，而罢免了朱勔。
童贯的这一手果然凑效，于是一些参加起义军立场不坚定的百姓纷纷动摇离开了起义军，使起义军的力量大减。并且起义军自从秀州一败，一败败到杭州，使起义军斗志军心更是雪上加霜。